疥虫的病源为天竺鼠生活环境的污染。它主要寄居在天竺鼠的眼部和耳朵的四周。疥虫会引起疥癣，就好象是疥虫吃掉了天竺鼠的毛，使患处产生斑秃。一旦发现疥虫迹象，要请医生诊治，一般的治疗方法是注射杀虫针剂。也可用农用敌白虫按1比100稀释了涂抹患处，（天竺鼠添了一点没有大碍）。另外需要注意的是要将鼠笼彻底消毒，否则疥虫会卷土重来。
微菌性感染
主要症状是头部出现斑秃，与疥虫症状极其相似，有时甚至医生都无法分辨。这种病状是由于空气湿度大，以及长期吃浓缩饲料等造成。此病症类似于人类的香港脚，皮肤上会产生皮屑。
腹泻
由于使用了不干净的食物引起的肠胃炎。症状很明显，即粪便不成形。发现此症状请立即送医就诊。腹泻对于天竺鼠是相当危险的，因为有时我们不知道是那些食物引起的腹泻，如是普通的腹泻吃药就可以好，如是因食用了化学物质中毒而引起的腹泻，就算是在第一时间送诊也很难挽回性命。所以千万要小心
胀气
食用了不适宜的食物造成，比如梨子。胀气会导致窒息和心脏衰竭。所以情况严重时要及早送医。
便秘
由于食物过于干燥和饮水不足引致。只要增加饮水量以及提供蔬菜水果等多水分的食物便可治愈。
掉毛过多
天竺鼠掉毛就像人类掉头发一样是很正常的。不过大量掉毛则不正常，是由于缺乏维他命 C 引起的。治疗方法是通过将粉末状维他命 C 混入食物或水中来予以补充。维生素粉末是酸味的，所以有的天竺鼠会避而不食，这时就要用针筒喂给它们。
外伤
及时在流血的部位擦动物专用碘酒以防细菌侵入。
